Çıplak DNA’nın nanoakışkan lineerizasyonu ve optik haritalaması araştırma literatüründe rapor edilmiş ve ticari cihazlarda uygulanmıştır. Bununla birlikte, DNA özelliklerinin çözülebileceği çözünürlük, hem Brownian hareketi hem de kırınımla sınırlı optikler tarafından doğası gereği hala sınırlıdır. Doğal kromatinin doğrudan analizi, DNA analizi için rutin olarak kullanılan elektroforetik manipülasyondaki zorluk nedeniyle daha da engellenir. Bu makale, doğal kromatinin elektroforetik olmayan doğrusallaştırılmasını ve hareketsizleştirilmesini sağlayan üç katmanlı, ayarlanabilir, nanokanallı bir sistemin geliştirilmesini açıklamaktadır. Ayrıca, kendi kendine yanıp sönen flüoresan boyaların dikkatli seçimi ve nanokanal sisteminin tasarımı yoluyla, doğrusallaştırılmış kromatinin doğrudan stokastik optik rekonstrüksiyon mikroskobu (dSTORM) süper çözünürlüklü görüntülemesini elde ediyoruz. İlk gösterim olarak, rDNA kromatini ekstrakte edildi. Tetrahymena toplam DNA’nın, yeni sentezlenen DNA’nın ve yeni sentezlenen histon H3’ün çok renkli görüntülenmesiyle analiz edilir. Analizimiz, yeni sentezlenen H3’ün, palindromik simetri ile rDNA kromatinin iki yarısı boyunca nispeten eşit bir dağılımını ortaya koyuyor ve bu da dağıtıcı nükleozom ayrışmasını destekliyor. Bir kavram kanıtı çalışması olarak çalışmamız, ayarlanabilir nanokanallarda doğrusallaştırılmış ve hareketsizleştirilmiş doğal kromatin liflerinin süper çözünürlüklü görüntülenmesini sağlıyor. Genetik bilgilerin yanı sıra uzun menzilli ve yüksek çözünürlüklü epigenetik bilgilerin toplanması için yeni bir yol açar.
İçeriğiniz yüklenirken lütfen bekleyin…Source: pubs.rsc.org